【识别要点】 茎：发病部位主要在茎基部和茎分叉处，初始产生水浸状斑，扩大后呈淡褐色，病茎软腐纵裂，病部以上茎蔓和叶凋萎枯死；果实：初时在幼果脐部，水浸状腐烂；叶片：初呈水浸状斑，扩大后成灰褐色近圆形大斑，边缘不明显，病部软腐，并产生白色棉絮状菌丝。
【抗耐病品种】 暂无。
【防控关键期】 4～11月为主要发生期，8月为高发期。
【应急防控措施】
（1）生物防治：目前暂无登记药剂。
（2）化学防治：目前暂无登记药剂。
【针对蜜蜂农药副作用持续期】 以上药剂暂无记录。
【针对天敌农药副作用持续期】 以上药剂暂无记录。
【重要注意事项】 混用容易出问题药剂、个别药剂对作物敏感等。
【发病规律】甜瓜菌核病喜温暖的环境条件。据观察，温度在20-25℃条件下易使病害流行，低于15℃以下或高于32℃以上时病情减缓。空气湿度大于70%，尤其当空气湿度在85%以上病情加重，甜瓜菌核病流行快，是一种典型的喜湿病害，空气干燥时发病轻。结果初期光照充足的年份或季节，菌核病少，传播慢，为害轻。若结果早期阴天多，光照不好，病害发生早，流行快，病害重，防治难度也大。
【症状】 甜瓜菌核病主要危害茎基部和果实，也能危害茎蔓和叶，在甜瓜苗期至成株期均可发生。
茎染病，发病部位主要在茎基部和茎分叉处，发病初始产生水浸状斑，扩大后呈淡褐色，病茎软腐纵裂，病部以上茎蔓和叶凋萎枯死。湿度高时病部长出一层白色棉絮状菌丝体，受害后茎干内髓部受破坏，发病末期腐烂而中空，剥开可见白色菌丝体和黑色菌核。菌核鼠粪状，圆形或不规则形，早期白色，以后外部变为黑色，内部白色。[5]
果实染病，发病初时在幼果脐部，水浸状腐烂，果表长白色棉絮状菌丝及形成黑色粒状菌核。
叶片染病，初呈水浸状斑，扩大后成灰褐色近圆形大斑，边缘不明显，病部软腐，并产生白色棉絮状菌丝，一般在叶片上不产生黑色鼠粪状菌核，只在发病严重时产生黑色鼠粪状菌核。
【病原】Sclerotinia scleroriorum (Lib.) de Bary，属子囊菌亚门、柔膜菌目、核盘菌属真菌，菌丝体白色，绵絮状，粗细不一，直径3-4微米，透明，有横隔，内有浓蜜的颗粒状物。子囊盘杯状，浅肉色至褐色，1个至4个从菌核上生出，子囊盘直径0.3-0.8厘米，柄褐色细长，微弯曲，长4厘米左右，由盘基部向下渐细。子囊棍棒状，无色，（108-135）微米×（9-10）微米，内含8个子囊孢子，子囊孢子单行排列，椭圆形，无色，12微米×4微米；小型分生孢子单胞，无色，3-4微米，密生于分生孢子梗上，形成84微米×77微米的孢子块。侧丝细长，线形，夹生在子囊之间。