危害食用菌的双翅目蝇类昆虫总称为菇蝇，主要有蚤蝇、粪蝇、果蝇及扁足蝇等。
【识别要点】有膜质前翅一对，后翅退化为平衡棒，足三对，爪一对，口器适于刮吸、舐吸。
【为害特点】幼虫为害培养料、菌丝和子实体，吸吮菌丝体营养，使菌丝衰退，菌蕾因缺乏养分而枯死，当大量发生时，会招致青霉菌的发生、传播枝霉、石膏霉及细菌性病害，同时还是螨类的携带媒介。
【防控关键期】防治最佳期为卵孵高峰至低龄幼虫高峰期。
【防控措施】
1.搞好菇房及周围环境卫生，尽量减少虫源。尤其需彻底清除菇根、菇柄、弱菇、烂菇等富含腐殖质的产菇后的垃圾，集中高温发酵堆沤处理。
2.安装60目以上纱门、纱窗，防止害虫传入菇房。
3.在种菇前，对菇房及菇场用杀虫剂灭虫。
4.设置黑光灯或高压静电灭虫灯诱杀成虫。
5.在培养料搅拌前，选用80%灭蝇胺水分散粒剂0.5-0.63/100千克湿料（三嗪类农药；每季最多1次）进行拌料处理，注意混合均匀，用水量15L/1000kg湿料。
6.在平菇菇蝇低龄幼虫期，选用10%吡虫啉可湿性粉剂1500-2500倍液（硝基亚甲基类杀虫剂，安全间隔期7天，每季最多1次）均匀喷雾菌袋接种口表面。